Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF4P48230 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF4P48230 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF4P48230 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF4P48230 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF4P48230 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF4P48230 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF4P48230 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF4P48230 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF4P48230 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF4P48230 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF4P48230 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF4P48230 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TM4SF4P48230 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF4P48230 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF4P48230 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF4P48230 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF4P48230 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF4P48230 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF4P48230 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF4P48230 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF4P48230 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF4P48230 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF4P48230 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF4P48230 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TM4SF4P48230 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TM4SF4P48230 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF4P48230 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF4P48230 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms