Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP13P45452 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP13P45452 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP13P45452 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP13P45452 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP13P45452 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP13P45452 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP13P45452 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP13P45452 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP13P45452 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP13P45452 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP13P45452 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP13P45452 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP13P45452 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP13P45452 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP13P45452 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP13P45452 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP13P45452 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP13P45452 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP13P45452 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP13P45452 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP13P45452 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP13P45452 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP13P45452 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP13P45452 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP13P45452 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP13P45452 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP13P45452 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP13P45452 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP13P45452 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP13P45452 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP13P45452 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP13P45452 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP13P45452 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP13P45452 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP13P45452 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP13P45452 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP13P45452 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP13P45452 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP13P45452 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP13P45452 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP13P45452 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP13P45452 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP13P45452 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP13P45452 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP13P45452 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP13P45452 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP13P45452 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP13P45452 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP13P45452 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP13P45452 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP13P45452 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP13P45452 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP13P45452 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP13P45452 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP13P45452 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP13P45452 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP13P45452 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms