Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA4P43681 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms