Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DCCP43146 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DCCP43146 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DCCP43146 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DCCP43146 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DCCP43146 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
DCCP43146 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DCCP43146 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DCCP43146 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
DCCP43146 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DCCP43146 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
DCCP43146 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DCCP43146 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
DCCP43146 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DCCP43146 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DCCP43146 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DCCP43146 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DCCP43146 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DCCP43146 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DCCP43146 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DCCP43146 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DCCP43146 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DCCP43146 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DCCP43146 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DCCP43146 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
DCCP43146 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
DCCP43146 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
DCCP43146 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33■■■□□ 2.87
DCCP43146 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
DCCP43146 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33■■■□□ 2.87
DCCP43146 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
DCCP43146 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DCCP43146 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
DCCP43146 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DCCP43146 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
DCCP43146 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DCCP43146 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DCCP43146 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DCCP43146 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DCCP43146 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
DCCP43146 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DCCP43146 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DCCP43146 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
DCCP43146 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DCCP43146 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DCCP43146 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DCCP43146 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DCCP43146 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DCCP43146 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DCCP43146 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DCCP43146 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DCCP43146 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DCCP43146 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DCCP43146 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DCCP43146 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DCCP43146 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DCCP43146 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DCCP43146 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DCCP43146 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DCCP43146 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DCCP43146 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DCCP43146 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DCCP43146 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DCCP43146 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DCCP43146 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DCCP43146 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DCCP43146 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DCCP43146 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DCCP43146 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DCCP43146 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DCCP43146 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DCCP43146 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DCCP43146 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DCCP43146 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DCCP43146 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DCCP43146 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DCCP43146 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DCCP43146 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DCCP43146 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
DCCP43146 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DCCP43146 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DCCP43146 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
DCCP43146 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DCCP43146 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
DCCP43146 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DCCP43146 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DCCP43146 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DCCP43146 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
DCCP43146 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DCCP43146 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DCCP43146 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms