Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX11P35716 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX11P35716 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX11P35716 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX11P35716 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX11P35716 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX11P35716 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX11P35716 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX11P35716 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX11P35716 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX11P35716 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX11P35716 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX11P35716 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX11P35716 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX11P35716 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX11P35716 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX11P35716 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX11P35716 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX11P35716 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX11P35716 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX11P35716 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX11P35716 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX11P35716 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX11P35716 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX11P35716 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX11P35716 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX11P35716 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX11P35716 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX11P35716 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX11P35716 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX11P35716 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX11P35716 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX11P35716 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX11P35716 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX11P35716 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX11P35716 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX11P35716 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX11P35716 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX11P35716 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX11P35716 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX11P35716 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX11P35716 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX11P35716 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX11P35716 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX11P35716 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX11P35716 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX11P35716 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX11P35716 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX11P35716 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX11P35716 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX11P35716 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX11P35716 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX11P35716 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX11P35716 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX11P35716 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX11P35716 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX11P35716 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX11P35716 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX11P35716 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX11P35716 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms