Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA7P31268 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
HOXA7P31268 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA7P31268 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA7P31268 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA7P31268 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HOXA7P31268 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HOXA7P31268 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HOXA7P31268 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA7P31268 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA7P31268 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA7P31268 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXA7P31268 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA7P31268 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXA7P31268 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXA7P31268 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXA7P31268 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXA7P31268 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA7P31268 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA7P31268 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA7P31268 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA7P31268 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA7P31268 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA7P31268 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA7P31268 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA7P31268 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA7P31268 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA7P31268 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA7P31268 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA7P31268 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA7P31268 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA7P31268 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA7P31268 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HOXA7P31268 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HOXA7P31268 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXA7P31268 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms