Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A5P29400 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A5P29400 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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