Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALRP27797 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALRP27797 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALRP27797 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALRP27797 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALRP27797 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALRP27797 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALRP27797 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALRP27797 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALRP27797 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALRP27797 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALRP27797 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALRP27797 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALRP27797 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALRP27797 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALRP27797 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALRP27797 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALRP27797 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALRP27797 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALRP27797 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALRP27797 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALRP27797 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALRP27797 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALRP27797 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALRP27797 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALRP27797 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALRP27797 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALRP27797 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALRP27797 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALRP27797 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALRP27797 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALRP27797 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALRP27797 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALRP27797 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALRP27797 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALRP27797 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALRP27797 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALRP27797 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALRP27797 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CALRP27797 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALRP27797 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALRP27797 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALRP27797 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALRP27797 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALRP27797 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALRP27797 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALRP27797 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALRP27797 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALRP27797 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALRP27797 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALRP27797 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALRP27797 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALRP27797 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALRP27797 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALRP27797 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALRP27797 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALRP27797 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALRP27797 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALRP27797 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms