Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARK3P27448 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARK3P27448 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARK3P27448 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARK3P27448 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARK3P27448 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARK3P27448 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARK3P27448 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARK3P27448 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARK3P27448 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARK3P27448 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARK3P27448 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARK3P27448 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARK3P27448 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARK3P27448 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARK3P27448 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MARK3P27448 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MARK3P27448 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARK3P27448 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARK3P27448 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MARK3P27448 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARK3P27448 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARK3P27448 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MARK3P27448 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARK3P27448 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARK3P27448 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARK3P27448 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARK3P27448 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARK3P27448 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARK3P27448 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARK3P27448 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARK3P27448 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MARK3P27448 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARK3P27448 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARK3P27448 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARK3P27448 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARK3P27448 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARK3P27448 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARK3P27448 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MARK3P27448 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARK3P27448 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARK3P27448 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARK3P27448 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARK3P27448 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARK3P27448 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARK3P27448 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARK3P27448 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARK3P27448 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARK3P27448 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARK3P27448 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARK3P27448 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARK3P27448 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARK3P27448 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARK3P27448 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARK3P27448 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MARK3P27448 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARK3P27448 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MARK3P27448 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MARK3P27448 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MARK3P27448 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARK3P27448 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARK3P27448 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARK3P27448 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARK3P27448 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MARK3P27448 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MARK3P27448 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARK3P27448 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARK3P27448 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARK3P27448 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARK3P27448 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARK3P27448 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARK3P27448 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARK3P27448 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARK3P27448 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARK3P27448 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARK3P27448 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARK3P27448 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARK3P27448 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MARK3P27448 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MARK3P27448 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARK3P27448 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.3 ms