Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL3RAP26951 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IL3RAP26951 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms