Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL13P26373 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL13P26373 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL13P26373 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL13P26373 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL13P26373 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL13P26373 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL13P26373 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL13P26373 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL13P26373 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL13P26373 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL13P26373 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL13P26373 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL13P26373 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL13P26373 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL13P26373 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL13P26373 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL13P26373 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL13P26373 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL13P26373 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL13P26373 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL13P26373 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL13P26373 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL13P26373 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL13P26373 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL13P26373 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL13P26373 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL13P26373 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL13P26373 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL13P26373 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL13P26373 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL13P26373 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL13P26373 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL13P26373 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL13P26373 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL13P26373 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL13P26373 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL13P26373 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL13P26373 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL13P26373 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL13P26373 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL13P26373 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL13P26373 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL13P26373 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL13P26373 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL13P26373 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL13P26373 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL13P26373 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL13P26373 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL13P26373 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL13P26373 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL13P26373 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL13P26373 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL13P26373 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL13P26373 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL13P26373 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL13P26373 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL13P26373 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL13P26373 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL13P26373 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL13P26373 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL13P26373 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL13P26373 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL13P26373 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL13P26373 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL13P26373 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL13P26373 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL13P26373 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL13P26373 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL13P26373 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL13P26373 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL13P26373 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL13P26373 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL13P26373 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL13P26373 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPL13P26373 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPL13P26373 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPL13P26373 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms