Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 NUP160-206ENST00000528071 4138 ntTSL 512.14□□□□□ -0.474e-13■■■■■ 34
U2AF2P26368 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.04□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 34
U2AF2P26368 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 523.91■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 34
U2AF2P26368 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 423.43■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 34
U2AF2P26368 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 421.96■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 34
U2AF2P26368 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 34
U2AF2P26368 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 34
U2AF2P26368 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 34
U2AF2P26368 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.46e-26■■■■■ 34
U2AF2P26368 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.756e-12■■■■■ 34
U2AF2P26368 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.156e-12■■■■■ 34
U2AF2P26368 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.136e-12■■■■■ 34
U2AF2P26368 CYTH2-212ENST00000600597 293 ntTSL 57.48□□□□□ -1.215e-17■■■■■ 34
U2AF2P26368 EXOC1-203ENST00000381295 3551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-13■■■■■ 34
U2AF2P26368 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.261e-13■■■■■ 34
U2AF2P26368 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.611e-13■■■■■ 34
U2AF2P26368 LRP6-202ENST00000535731 562 ntTSL 321.12■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 33.9
U2AF2P26368 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 33.9
U2AF2P26368 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 33.9
U2AF2P26368 FNBP4-203ENST00000525316 412 ntTSL 34.32□□□□□ -1.723e-16■■■■■ 33.9
U2AF2P26368 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.451e-9■■■■■ 33.9
U2AF2P26368 PDLIM5-212ENST00000509333 743 ntTSL 218.13■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 PDLIM5-220ENST00000514830 802 ntTSL 213.75□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 PDLIM5-214ENST00000510099 554 ntTSL 45.53□□□□□ -1.523e-9■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 PDLIM5-211ENST00000508531 480 ntTSL 45.23□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.876e-8■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.16■■□□□ 1.146e-8■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 562 ntAPPRIS P5 TSL 318.97■□□□□ 0.636e-8■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 TMEM256-203ENST00000576017 511 ntTSL 39.95□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 RAD51AP1-214ENST00000544931 1024 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.953e-11■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 RAD51AP1-205ENST00000535558 1333 ntTSL 27.33□□□□□ -1.243e-11■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.443e-11■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 RAD51AP1-203ENST00000398012 1036 ntTSL 25.76□□□□□ -1.493e-11■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.543e-11■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 RAD51AP1-204ENST00000442992 2235 ntTSL 54.84□□□□□ -1.643e-11■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.783e-11■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.413e-15■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.563e-15■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 SPEN-203ENST00000442985 891 ntTSL 55.15□□□□□ -1.593e-8■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 OCIAD1-211ENST00000507210 582 ntTSL 317.21■□□□□ 0.357e-7■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 OCIAD1-220ENST00000509963 432 ntTSL 214.78□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 OCIAD1-228ENST00000514981 653 ntTSL 312.8□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 OCIAD1-224ENST00000512236 594 ntTSL 310.42□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 OCIAD1-221ENST00000510824 582 ntTSL 310.24□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 OCIAD1-218ENST00000509246 495 ntTSL 24.5□□□□□ -1.697e-7■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 OCIAD1-222ENST00000511102 688 ntTSL 23.32□□□□□ -1.887e-7■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 OCIAD1-208ENST00000504654 552 ntTSL 33.32□□□□□ -1.887e-7■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-19■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 PRPF38A-202ENST00000474048 1059 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.532e-19■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 PRPF38A-203ENST00000487160 926 ntTSL 23.24□□□□□ -1.892e-19■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 FTX-202ENST00000423992 696 ntTSL 512.38□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 33.8
U2AF2P26368 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 MAGOH-203ENST00000462941 738 ntTSL 212.82□□□□□ -0.362e-11■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.583e-8■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 CC2D1A-203ENST00000586955 2743 ntTSL 1 (best)19.46■□□□□ 0.713e-12■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 CC2D1A-206ENST00000589138 2435 ntTSL 519.24■□□□□ 0.673e-12■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-12■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-12■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 DLG1-224ENST00000475394 864 ntTSL 53□□□□□ -1.935e-12■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-9■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 C8orf76-204ENST00000519791 569 ntTSL 214.97□□□□□ -0.011e-9■■■■■ 33.7
U2AF2P26368 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.292e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.062e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-207ENST00000549759 559 ntTSL 314.52□□□□□ -0.092e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-208ENST00000549995 598 ntTSL 313.53□□□□□ -0.242e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-204ENST00000547130 559 ntTSL 213.52□□□□□ -0.252e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-216ENST00000552341 1980 ntTSL 212.6□□□□□ -0.392e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-201ENST00000243040 564 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.492e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-212ENST00000550880 595 ntTSL 211.95□□□□□ -0.52e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-210ENST00000550513 939 ntTSL 311.89□□□□□ -0.512e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-218ENST00000552742 571 ntTSL 311.08□□□□□ -0.642e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-215ENST00000551223 478 ntTSL 410.74□□□□□ -0.692e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-203ENST00000351500 478 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.022e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.022e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-217ENST00000552548 497 ntTSL 28.09□□□□□ -1.112e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-205ENST00000547228 726 ntTSL 56.24□□□□□ -1.412e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 PFDN5-209ENST00000550069 599 ntTSL 26.01□□□□□ -1.452e-15■■■■■ 33.6
U2AF2P26368 TBL1XR1-233ENST00000637659 3105 ntTSL 55.48□□□□□ -1.535e-14■■■■■ 33.5
U2AF2P26368 TBL1XR1-226ENST00000636348 100 ntTSL 52.66□□□□□ -1.985e-14■■■■■ 33.5
U2AF2P26368 TBL1XR1-228ENST00000636864 6888 ntTSL 52.33□□□□□ -2.045e-14■■■■■ 33.5
U2AF2P26368 TBL1XR1-218ENST00000626758 355 ntTSL 51.4□□□□□ -2.195e-14■■■■■ 33.5
U2AF2P26368 GABRE-211ENST00000491339 2072 ntTSL 29.63□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 33.5
U2AF2P26368 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 33.5
U2AF2P26368 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 33.5
U2AF2P26368 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 33.5
U2AF2P26368 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 33.5
U2AF2P26368 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.373e-11■■■■■ 33.4
U2AF2P26368 KDM3B-207ENST00000510866 6324 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.173e-11■■■■■ 33.4
U2AF2P26368 KDM3B-204ENST00000507996 3034 ntTSL 27.44□□□□□ -1.223e-11■■■■■ 33.4
U2AF2P26368 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.393e-11■■■■■ 33.4
U2AF2P26368 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 33.4
U2AF2P26368 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 33.4
U2AF2P26368 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.725e-7■■■■■ 33.4
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 478 ms