RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570600.5

TMEM256-PLSCR3-202, Transcript of TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene TMEM256-PLSCR3, Length 1,526 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.22■■■■■ 5.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.77■■■■■ 4.28
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ABCC9O60706 1549 aa40.87■■■■■ 4.13
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TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.26■■■■□ 3.88
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.05■■■■□ 3.84
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.99■■■■□ 3.83
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.43■■■■□ 3.74
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.29■■■■□ 3.72
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SCRIBQ14160 1630 aa38.28■■■■□ 3.72
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.18■■■■□ 3.7
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.59■■■■□ 3.61
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.45■■■■□ 3.59
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.92■■■■□ 3.5
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.87■■■■□ 3.49
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SMARCA4P51532 1647 aa36.58■■■■□ 3.45
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.45■■■■□ 3.43
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.37■■■■□ 3.41
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NCAPD3P42695 1498 aa36.29■■■■□ 3.4
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SMARCA2P51531 1590 aa36.24■■■■□ 3.39
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.18■■■■□ 3.38
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 HMGXB3Q12766 1538 aa36.08■■■■□ 3.37
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TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NESP48681 1621 aa35.46■■■■□ 3.27
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.28■■■■□ 3.24
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.25■■■■□ 3.23
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.24■■■■□ 3.23
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ERCC6Q03468 1493 aa35.13■■■■□ 3.21
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CFTRP13569 1480 aa35.08■■■■□ 3.21
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.02■■■■□ 3.2
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.96■■■■□ 3.19
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.85■■■■□ 3.17
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.75■■■■□ 3.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PRDM2Q13029 1718 aa34.72■■■■□ 3.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.67■■■■□ 3.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CUX2O14529 1486 aa34.63■■■■□ 3.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 WDR62O43379 1518 aa34.54■■■■□ 3.12
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TOPBP1Q92547 1522 aa34.32■■■■□ 3.08
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.25■■■■□ 3.07
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ABCC8Q09428 1581 aa34.21■■■■□ 3.07
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CUX1P39880 1505 aa34.17■■■■□ 3.06
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 IFT140Q96RY7 1462 aa34.01■■■■□ 3.04
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34■■■■□ 3.03
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.99■■■■□ 3.03
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.97■■■■□ 3.03
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SYNJ1O43426 1573 aa33.94■■■■□ 3.02
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SOGA1O94964 1423 aa33.92■■■■□ 3.02
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TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.84■■■■□ 3.01
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.79■■■■□ 35e-14■■■■■ 78.5
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TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 WDR97A6NE52 1622 aa33.67■■■□□ 2.98
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.65■■■□□ 2.98
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.5■■■□□ 2.95
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.49■■■□□ 2.95
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 GRIN2BQ13224 1484 aa33.45■■■□□ 2.95
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.45■■■□□ 2.95
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.42■■■□□ 2.94
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PBRM1Q86U86 1689 aa33.39■■■□□ 2.94
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TRIM41Q8WV44 630 aa33.36■■■□□ 2.93
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 FBLN2P98095 1184 aa33.33■■■□□ 2.93
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 OSCARQ8IYS5 282 aa33.31■■■□□ 2.92
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CHD1O14646 1710 aa33.28■■■□□ 2.92
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 KIF27Q86VH2 1401 aa33.24■■■□□ 2.91
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TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.21■■■□□ 2.91
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TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 IGF1RP08069 1367 aa33.15■■■□□ 2.9
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.15■■■□□ 2.9
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.11■■■□□ 2.89
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 GRIN2AQ12879 1464 aa33.05■■■□□ 2.88
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.93■■■□□ 2.86
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.92■■■□□ 2.86
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CUL7Q14999 1698 aa32.92■■■□□ 2.86
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CEP170Q5SW79 1584 aa32.91■■■□□ 2.86
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NUP160Q12769 1436 aa32.89■■■□□ 2.86
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ARHGEF11O15085 1522 aa32.78■■■□□ 2.84
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.75■■■□□ 2.83
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.75■■■□□ 2.83
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.75■■■□□ 2.83
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.72■■■□□ 2.83
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.72■■■□□ 2.83
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