Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAMP1P23763 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms