Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMB1P20618 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB1P20618 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB1P20618 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms