Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCK1P16333 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCK1P16333 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCK1P16333 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCK1P16333 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCK1P16333 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCK1P16333 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCK1P16333 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCK1P16333 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCK1P16333 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCK1P16333 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCK1P16333 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCK1P16333 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCK1P16333 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCK1P16333 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCK1P16333 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCK1P16333 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCK1P16333 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCK1P16333 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCK1P16333 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCK1P16333 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCK1P16333 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCK1P16333 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCK1P16333 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCK1P16333 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCK1P16333 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCK1P16333 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCK1P16333 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCK1P16333 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCK1P16333 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCK1P16333 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCK1P16333 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCK1P16333 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCK1P16333 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCK1P16333 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCK1P16333 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCK1P16333 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCK1P16333 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCK1P16333 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCK1P16333 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCK1P16333 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCK1P16333 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCK1P16333 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCK1P16333 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCK1P16333 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCK1P16333 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCK1P16333 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCK1P16333 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCK1P16333 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCK1P16333 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCK1P16333 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCK1P16333 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCK1P16333 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCK1P16333 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCK1P16333 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCK1P16333 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCK1P16333 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCK1P16333 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCK1P16333 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCK1P16333 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCK1P16333 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCK1P16333 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCK1P16333 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCK1P16333 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCK1P16333 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCK1P16333 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCK1P16333 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCK1P16333 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCK1P16333 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCK1P16333 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCK1P16333 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCK1P16333 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCK1P16333 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCK1P16333 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCK1P16333 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCK1P16333 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCK1P16333 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCK1P16333 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCK1P16333 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCK1P16333 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms