Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPAP09012 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPAP09012 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms