Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGB3P05106 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB3P05106 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3P05106 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms