Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX6O95503 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX6O95503 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX6O95503 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX6O95503 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX6O95503 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX6O95503 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX6O95503 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBX6O95503 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBX6O95503 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX6O95503 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX6O95503 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX6O95503 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX6O95503 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX6O95503 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX6O95503 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX6O95503 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX6O95503 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX6O95503 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX6O95503 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX6O95503 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX6O95503 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX6O95503 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX6O95503 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX6O95503 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX6O95503 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX6O95503 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms