Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM24O75264 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM24O75264 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM24O75264 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms