Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM4AO75164 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM4AO75164 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM4AO75164 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms