Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNSO60931 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNSO60931 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNSO60931 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNSO60931 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNSO60931 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNSO60931 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNSO60931 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNSO60931 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNSO60931 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNSO60931 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNSO60931 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNSO60931 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNSO60931 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNSO60931 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNSO60931 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNSO60931 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNSO60931 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNSO60931 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNSO60931 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNSO60931 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNSO60931 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNSO60931 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNSO60931 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNSO60931 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNSO60931 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNSO60931 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNSO60931 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNSO60931 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNSO60931 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNSO60931 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNSO60931 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNSO60931 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNSO60931 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNSO60931 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNSO60931 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNSO60931 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNSO60931 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNSO60931 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNSO60931 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNSO60931 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNSO60931 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNSO60931 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNSO60931 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNSO60931 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNSO60931 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNSO60931 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNSO60931 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNSO60931 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNSO60931 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNSO60931 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNSO60931 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNSO60931 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNSO60931 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNSO60931 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNSO60931 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNSO60931 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNSO60931 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNSO60931 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNSO60931 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNSO60931 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNSO60931 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNSO60931 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNSO60931 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNSO60931 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNSO60931 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNSO60931 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNSO60931 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNSO60931 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNSO60931 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNSO60931 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNSO60931 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNSO60931 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNSO60931 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNSO60931 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNSO60931 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNSO60931 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms