Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA5O60264 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA5O60264 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMARCA5O60264 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms