Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPIPA5E9PKD4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPA5E9PKD4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms