Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HHLA1C9JL84 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HHLA1C9JL84 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HHLA1C9JL84 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms