Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms