Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC35F4A4IF30 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35F4A4IF30 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.3 ms