Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PMF1-BGLAPU3KQ54 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms