Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN7Q9Y6W3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN7Q9Y6W3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN7Q9Y6W3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms