Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYVE1Q9Y5Y7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYVE1Q9Y5Y7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms