Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COL4A3BPQ9Y5P4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A3BPQ9Y5P4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms