Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HES2Q9Y543 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HES2Q9Y543 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms