Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3HQ9Y535 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.8 ms