Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UTP11Q9Y3A2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms