Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FCF1Q9Y324 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms