Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2AQ9UQM7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMK2AQ9UQM7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMK2AQ9UQM7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms