Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms