Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MED23Q9ULK4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MED23Q9ULK4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms