Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCTPQ9UKL6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCTPQ9UKL6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms