Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RCOR1Q9UKL0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCOR1Q9UKL0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms