Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM7Q9UK45 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms