Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE7Q9UBL6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms