Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms