Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP35Q9P2H5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP35Q9P2H5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
USP35Q9P2H5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
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