Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDK12Q9NYV4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK12Q9NYV4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDK12Q9NYV4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDK12Q9NYV4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms