Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TMOD3Q9NYL9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMOD3Q9NYL9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TMOD3Q9NYL9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
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