Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL3Q9NYJ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL3Q9NYJ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 696.9 ms