Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAH9Q9NYC9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNAH9Q9NYC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms