Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SAMSN1Q9NSI8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMSN1Q9NSI8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMSN1Q9NSI8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms