Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HOMER2Q9NSB8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOMER2Q9NSB8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HOMER2Q9NSB8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms